高中生夜科扬羽在电话亭捡到一张神秘的红色电话卡，数日后，同样持有此卡的青梅竹马雨宫樱子突然失踪。追寻她的扬羽被卷入全国连环失踪事件的传闻，据说幕后是一个名为“PSYREN”的秘密组织。当他接入其中，一场改变命运的死亡游戏就此开始。
